당뇨병성 족부감염을 일으키는 원인균이 최신 염기서열 분석법인 나노포어 시퀀싱(nanopore sequencing) 기술로 정확히 파악할 수 있다고 서울대병원 연구팀이 7일 밝혔다.

서울대병원 문장섭ㆍ이동연ㆍ주건 교수팀은 “당뇨병성 족부감염 환자의 조직 샘플로 실험을 했을 때 나노포어 시퀀싱 기술은 기존 배양검사보다 분석 성능이 우수하고 속도가 빨랐다”고 전했다. 이 연구 결과는 국제학술지 <당뇨(Diabetes)> 최신호에 논문으로 게재됐다.

그에 따르면 연구팀은 환자에게서 수술 중 채취한 54개의 괴사조직 샘플을 활용하여 새로운 기술과 기존 검사의 성능을 비교했다. 그 결과 새로운 시퀀싱 기술은 복합세균감염을 더 많이 찾아냈다.

새 기술은 표본 중 약 81%(44/54)를 복합세균감염으로 진단했으나, 기존 배양 검사는 약 51%(32/54)에 그쳤다. 기존 검사는 12개 복합세균감염을 단일세균감염(10개)으로 잘못 파악하거나 균 동정 자체에 실패(2개)했다.

더욱이 시퀀싱 기술은 복합세균감염 속에서 가장 풍부하게 존재하는 세균이 무엇인지 파악하고 각 세균을 상대적으로 정량화할 수 있었다. 새 기술을 통해 가장 많이 존재하는 것으로 밝혀진 세균이 기존 배양검사에서는 동정되지 않는 경우가 빈번했다. 배양 검사로 동정된 세균이 시퀀싱으로 확인한 결과 병변 내에 매우 적게 존재하는 사례도 흔했다.

또한 기존 배양 검사는 프레보텔라, 박테로이데스 등 일부 혐기성균을 검출해낼 수 없었지만, 새로운 시퀀싱 기술에서는 검출이 가능하여 우수한 민감도를 보였다.

배양검사에 의존한 기존의 당뇨병성 족부감염 원인균 탐색과정이 실제 존재하는 세균 조성을 충분히 반영하지 못하고 있음을 이번 연구를 통해 확인한 것이다.

분석 속도도 기존 배양검사에 비해 훨씬 빨랐다. 일반 배양검사는 세균을 배양해 파악하는데 보통 2-3일에서 1주일까지 소요되는 반면, 시퀀싱을 통한 새로운 분석법은 대부분 1일 이내에 원인균을 찾아냈다.

임상유전체의학과 문장섭 교수는 “이번 연구는 최신 분자유전학 기술을 활용하여 당뇨병성 족부감염 원인균을 정확하게 진단함으로써 환자의 예후 개선에 기여할 것”이라며 “기존 치료 패러다임을 바꿀 수 있을 것”으로 기대했다.